Source for file Io.inc
Documentation is available at Io.inc
-  * File and input handling routines 
-  * This class parses command-line options, and works with files to 
-  * generate lists of files to parse based on the ignore/include options 
-  * phpDocumentor :: automatic documentation generator 
-  * Copyright (c) 2000-2006 Joshua Eichorn, Gregory Beaver 
-  * This library is free software; you can redistribute it 
-  * and/or modify it under the terms of the GNU Lesser General 
-  * Public License as published by the Free Software Foundation; 
-  * either version 2.1 of the License, or (at your option) any 
-  * This library is distributed in the hope that it will be useful, 
-  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of 
-  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU 
-  * Lesser General Public License for more details. 
-  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public 
-  * License along with this library; if not, write to the Free Software 
-  * Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA 
-  * @copyright  2000-2006 Joshua Eichorn, Gregory Beaver 
-  * @license    http://www.opensource.org/licenses/lgpl-license.php LGPL 
-  * @version    CVS: $Id: Io.inc 286921 2009-08-08 05:01:24Z ashnazg $ 
-  * @link       http://www.phpdoc.org 
-  * @link       http://pear.php.net/PhpDocumentor 
-  * Class to handle file and user io opperations 
-  * @version    $Id: Io.inc 286921 2009-08-08 05:01:24Z ashnazg $ 
-      * Holds all the options that are avaible to the cmd line interface 
-      * and to the different web interfaces 
-      * Format: array(array(regexp-ready string to search for whole path, 
-      * regexp-ready string to search for basename of ignore strings),...) 
-      * A specific array of values that boolean-based arguments can understand, 
-      * aided by the {@link decideOnOrOff()} helper method. 
-      * Use lowercase letters always, to simplify string comparisons 
-         '', ' ', 'on', 'y', 'yes', 'true', '1',  
-         'off', 'n', 'no', 'false', '0' 
-      * creates an array $this->phpDocOptions and sets program options in it. 
-      * Array is in the format of: 
-      * [filename][tag][] = "f"; 
-      * [filename][tag][] = "-file"; 
-      * [filename][desc] "name of file to parse" 
-         $this->phpDocOptions['filename']['tag'] - =  array( "-f", "--filename");
 
-         $this->phpDocOptions['filename']['desc'] - =  "name of file(s) to parse ',' file1,file2.  Can contain complete path and * ? wildcards";
 
-         $this->phpDocOptions['directory']['tag'] - =  array( "-d", "--directory");
 
-         $this->phpDocOptions['directory']['desc'] - =  "name of a directory(s) to parse directory1,directory2";
 
-         $this->phpDocOptions['examplesdir']['tag'] - =  array( "-ed", "--examplesdir");
 
-         $this->phpDocOptions['examplesdir']['desc'] - =  "full path of the directory to look for example files from @example tags";
 
-         $this->phpDocOptions['templatebase']['tag'] - =  array( "-tb", "--templatebase");
 
-         $this->phpDocOptions['templatebase']['desc'] - =  "base location of all templates for this parse.";
 
-         $this->phpDocOptions['target']['desc'] - =  "path where to save the generated files";
 
-         $this->phpDocOptions['ignore']['desc'] - =  "file(s) that will be ignored, multiple separated by ','.  Wildcards * and ? are ok";
 
-         $this->phpDocOptions['ignoresymlinks']['tag'] - =  array("-is", "--ignoresymlinks");
 
-         $this->phpDocOptions['ignoresymlinks']['desc'] - =  "ignore symlinks to other files or directories, default is off";
 
-         $this->phpDocOptions['ignoretags']['tag'] - =  array("-it", "--ignore-tags");
 
-         $this->phpDocOptions['ignoretags']['desc'] - =  "tags to ignore for this parse.  @package, @subpackage, @access and @ignore may not be ignored.";
 
-         $this->phpDocOptions['hidden']['tag'] - =  array("-dh", "--hidden");
 
-         $this->phpDocOptions['hidden']['desc'] - =  "set equal to on (-dh on) to descend into hidden directories (directories starting with '.'), default is off";
 
-         $this->phpDocOptions['quiet']['desc'] - =  "do not display parsing/conversion messages.  Useful for cron jobs on/off default off";
 
-         $this->phpDocOptions['undocumentedelements']['tag'] - =  array("-ue", "--undocumentedelements");
 
-         $this->phpDocOptions['undocumentedelements']['desc'] - =  "Control whether or not warnings will be shown for undocumented elements. Useful for identifying classes and methods that haven't yet been documented on/off default off";
 
-         $this->phpDocOptions['title']['desc'] - =  "title of generated documentation, default is 'Generated Documentation'";
 
-         $this->phpDocOptions['help']['desc'] - =  "    show this help message";
 
-         $this->phpDocOptions['useconfig']['tag'] - =  array("-c","--useconfig");
 
-         $this->phpDocOptions['useconfig']['desc'] - =  "Use a Config file in the users/ subdirectory for all command-line options";
 
-         $this->phpDocOptions['parseprivate']['tag'] - =  array("-pp","--parseprivate");
 
-         $this->phpDocOptions['parseprivate']['desc'] - =  "parse @internal and elements marked private with @access.  Use on/off, default off";
 
-         $this->phpDocOptions['parseprivate']['validvalues'] - =  array('on', 'off');
 
-         $this->phpDocOptions['packageoutput']['tag'] - =  array("-po","--packageoutput");
 
-         $this->phpDocOptions['packageoutput']['desc'] - =  "output documentation only for selected packages.  Use a comma-delimited list";
 
-         $this->phpDocOptions['defaultpackagename']['tag'] - =  array("-dn","--defaultpackagename");
 
-         $this->phpDocOptions['defaultpackagename']['desc'] - =  "name to use for the default package.  If not specified, uses 'default'";
 
-         $this->phpDocOptions['defaultcategoryname']['tag'] - =  array("-dc","--defaultcategoryname");
 
-         $this->phpDocOptions['defaultcategoryname']['desc'] - =  "name to use for the default category.  If not specified, uses 'default'";
 
-         $this->phpDocOptions['output']['desc'] - =  "output information to use separated by ','.  Format: output:converter:templatedir like \"HTML:frames:phpedit\"";
 
-         $this->phpDocOptions['converterparams']['tag'] - =  array("-cp","--converterparams");
 
-         $this->phpDocOptions['converterparams']['desc'] - =  "dynamic parameters for a converter, separate values with commas";
 
-         $this->phpDocOptions['customtags']['tag'] - =  array("-ct","--customtags");
 
-         $this->phpDocOptions['customtags']['desc'] - =  "custom tags, will be recognized and put in tags[] instead of unknowntags[]";
 
-         $this->phpDocOptions['sourcecode']['tag'] - =  array("-s","--sourcecode");
 
-         $this->phpDocOptions['sourcecode']['desc'] - =  "generate highlighted sourcecode for every parsed file (PHP 4.3.0+ only) on/off default off";
 
-         $this->phpDocOptions['sourcecode']['validvalues'] - =  array('on', 'off');
 
-         $this->phpDocOptions['javadocdesc']['tag'] - =  array("-j","--javadocdesc");
 
-         $this->phpDocOptions['javadocdesc']['desc'] - =  "JavaDoc-compliant description parsing.  Use on/off, default off (more flexibility)";
 
-         $this->phpDocOptions['javadocdesc']['validvalues'] - =  array('on', 'off');
 
-         $this->phpDocOptions['pear']['desc'] - =  "Parse a PEAR-style repository (package is directory, _members are @access private) on/off default off";
 
-         $this->phpDocOptions['pear']['validvalues'] - =  array('on', 'off');
 
-         $this->phpDocOptions['readmeinstallchangelog']['tag'] - =  array("-ric","--readmeinstallchangelog");
 
-         $this->phpDocOptions['readmeinstallchangelog']['desc'] - =  "Specify custom filenames to parse like README, INSTALL or CHANGELOG files";
 
-         $this->phpDocOptions['readmeinstallchangelog']['type'] - =  "value";
 
-         $this->phpDocOptions['general']['message'] - = "You can have multiple directories and multiple files, as well as a combination of both options";
 
-      * create the help message for display on the command-line 
-      * @return string a string containing a help message 
-                     foreach($data['tag'] as $param) { 
-                 $tmp - =  "  "- . trim($tag)- . $tagspace;
 
-                 $tmp - =  substr($tmp,0,$taglen);
 
-         for($i- = 1;$i- < count($dt);$i- ++ )
 
-             $dt[$i] - =  $tagspace- . $dt[$i];
 
-         $ret - .=  "\n"- . wordwrap($data['message'],$outputwidth)- . "\n";
 
-      * calls {@link file_exists()} for each value in include_path, 
-      * then calls {@link is_readable()} when it finds the file 
-             return true; // for absolute paths 
-             if ($a - =  realpath($path- .  DIRECTORY_SEPARATOR- .  $filename))
 
-      * Parses $_SERVER['argv'] and creates a setup array 
-      * @return array a setup array 
-      * @global array command-line arguments 
-      * @todo replace with Console_* ? 
-         $setting['hidden'] - =  "off";
 
-         $setting['ignoresymlinks'] - =  'off';
 
-                 if ($cmd - ==  '-h'- ||  $cmd- ==  '--help')
 
-                 // at first, set the arg value as if we 
-                 // already know it's formatted normally, e.g. 
-                 $setting[$valnext] - =  $cmd;
 
-                 if (- isset ($data['type'])- &&  $data['type']- ==  'set') {
 
-                     if ($valnext - !==  'junk'- &&  strpos(trim($cmd),'-')- ===  0) {
 
-                         // if valnext isn't 'junk' (i.e it was an arg option)  
-                         // then the first arg needs an implicit "" as its value, e.g. 
-                         //     ... -q -pp ...  ===>  ... -q '' -pp ...  
-                         // the arg value is not a valid value 
-                             '(' - .  implode(', ', $data['validvalues'])- .  ')');
 
-                     if (!empty($data['tag'])) 
-                 if ($valnext - ==  'junk'- &&  (strpos(trim($cmd),'-')- ===  0)) {
 
-                     // this indicates the last arg of the command  
-                     // is an arg option (-) that was preceded by unrecognized "junk" 
-                 } else if ($valnext - !=  'junk'- &&  (strpos(trim($cmd),'-')- ===  0)) {
 
-                     // this indicates the last arg of the command  
-                     // is an arg option (-) without an arg value 
-                     // add an empty arg "value" for this arg "option" 
-             echo  "Please use php-cli.exe in windows, or set register_argc_argv On";
-         /* $setting will always have at least 3 elements 
-         [ignoresymlinks] => 'off' 
-         [template] => templates/default 
-         if (count($setting) - <  4) {
 
-             echo  $this->displayhelpMsg();
-      * @return array list of files in a directory 
-      * @param string $directory full path to the directory you want the list of 
-      * @param bool whether to list files that begin with . like .bash_history 
-      * @param bool whether to ignore symlinks 
-     function dirList($orig_directory, $hidden - =  false, $ignore_symlinks- =  false)
 
-             die("directory: '$directory'  not found\n"); 
-         while($d - &&  ($entry- = $d->read())- !==  false) {
 
-             // skip hidden files, if we're supposed to 
-                 if (substr($entry,0,1) - ==  ".")
 
-             // skip symlink files, if we're supposed to 
-      * Retrieve common directory (case-insensitive in windows) 
-      * takes the list of files, and returns the subdirectory they share in common, 
-      * "/dir1/dir2/subdir/dir3/filename.ext", 
-      * "/dir1/dir2/subdir/dir4/filename.ext", 
-      * "/dir1/dir2/mydir/dir5/filename.ext"); 
-      * getBase will return "/dir1/dir2" 
-      * @param array array of strings 
-         foreach($filelist as $path) 
-                                 if ($mp[$i] - !=  $np[$i]) $found- =  $i;
 
-      * Retrieve tutorial subdirectories and their contents from the list of 
-      * @param array array of paths (strings) 
-      * @return array array(filelist - tutorials, tutorials) 
-         $list - =  $tutorials- =  array();
 
-         foreach($filelist as $file) 
-             if (strpos($file,'tutorials/') - !==  false)
 
-                 if (count($tutedir) - <=  3)
 
-                     // kludge - will need to fix for 2.0 
-                     $res['category'] - =  $GLOBALS['phpDocumentor_DefaultCategoryName'];
 
-                     if ($res['tutetype'] - ==  'ini') continue;
 
-         return array($list,$tutorials); 
-      * @param string base directory from {@link getBase()} 
-      * @param array file list from {@link dirList()} 
-      * @return array array(filelist - README/INSTALL/CHANGELOG, 
-      *                      README/INSTALL/CHANGELOG) 
-         $names - =  $GLOBALS['_phpDocumentor_RIC_files'];
 
-         foreach($filelist as $file) 
-             { // be sure to change $this->checkIgnore() if any other files are added here!! 
-         return array($list,$ric); 
-      * @param string directory 
-      * @param string base directory 
-      * @param array array of ignored items 
-      * @param boolean the "hidden" flag 
-      * @param boolean the "ignoresymlinks" flag 
-     function getDirTree($dir, $base_dir, $ignore - =  array(), $hidden- =  false, $ignoresymlinks- =  false)
 
-         $allfiles - =  $this->dirList($dir,$hidden,$ignoresymlinks);
 
-         foreach($allfiles as $file) 
-             if (!- isset ($parts['extension']))
 
-                 $parts['extension'] - =  '';
 
-                 'file' - =>  $parts['basename'],
 
-                 'ext' - =>  $parts['extension'],
 
-         uksort($struc,'strnatcasecmp'); 
-         foreach($struc as $key - =>  $ind)
 
-             usort($ind,'Ioinc_sortfiles'); 
-                     if (- isset ($struc[join('/',$key)]))
 
-         foreach($struc as $key - =>  $ind)
 
-                     $struc['/'][$key] - =  $struc[$key];
 
-         foreach($leftover_dirs as $dir) 
-         $leftover_dirs - =  array();
 
-         foreach($splitdirs as $dir) 
-             $struc['/'] - =  setup_dirs($struc['/'], $dir, $tempstruc[$save]);
 
-         @uksort($struc['/'],'Ioinc_mystrucsort'); 
-      * Reads a file and returns it as a string 
-      * Does basic error checking 
-      * file extensions are set in {@link phpdoc.inc} 
-      * @global array PHP File extensions, used to validate that $path is a PHP File 
-      * @global array PHP File extensions in a CVS repository, used to validate that $path is a PHP File 
-         global $_phpDocumentor_cvsphpfile_exts, $_phpDocumentor_phpfile_exts; 
-         $cvsExt - =  $_phpDocumentor_cvsphpfile_exts;
 
-         $ext - =  $_phpDocumentor_phpfile_exts;
 
-      * Tell whether to ignore a file or a directory 
-      * allows * and ? wildcards 
-      * @param    string  $file    just the file name of the file or directory, 
-      *                           in the case of directories this is the last dir 
-      * @param    string  $path    the path to consider (should be checked by 
-      *                             realpath() before, and may be relative) 
-      * @param    bool    Ignore symlinks? 
-      * @return   bool    true if $path should be ignored, false if it should not 
-     function checkIgnore($file,$path,$ignore,$ignore_no_ext - =  true,$ignoresymlinks- =  false)
 
-         global $_phpDocumentor_RIC_files; 
-         if (!count($ignore)) return false; 
-             foreach($this->ignore as $match) 
-                 // match is an array if the ignore parameter was a /path/to/pattern 
-                     // check to see if the path matches with a path delimiter appended 
-                         // check to see if it matches without an appended path delimiter 
-                         // check to see if the file matches the file portion of the regex string 
-                     // check to see if the full path matches the regex 
-                                strtoupper($path - .  DIRECTORY_SEPARATOR- .  $file), $find);
 
-                     // ignore parameter was just a pattern with no path delimiters 
-                     // check it against the path 
-                     // check it against the file only 
-      * Construct the {@link $ignore} array 
-      * @param array strings of files/paths/wildcards to ignore 
-         for($i- = 0; $i- < count($ignore);$i- ++ )
 
-             $ignore[$i] - =  strtr($ignore[$i], '\\', '/');
 
-      * Converts $s into a string that can be used with preg_match 
-      * @param string $s string with wildcards ? and * 
-      * @return string converts * to .*, ? to ., etc. 
-         if (DIRECTORY_SEPARATOR - ==  '\\')
 
-         $x - =  strtr($s, array('?'- =>  '.','*'- =>  '.*','.'- =>  '\\.','\\'- =>  '\\\\','/'- =>  '\\/',
 
-                                 '[' - =>  '\\[',']'- =>  '\\]','-'- =>  '\\-'));
 
-         if (strpos($s, DIRECTORY_SEPARATOR) - !==  false- && 
 
-             $x - =  "(?:.*$y$x?.*|$x.*)";
 
-      * Removes files from the $dir array that do not match the search string in 
-      * @param array $dir array of filenames (full path) 
-      * @param string $match search string with wildcards 
-      * @return string|arraylisting of every file in a directory that matches 
-         foreach($dir as $i - =>  $file)
 
-             if (!count($find)) - unset ($dir[$i]);
 
-         if ($nodir) return $dir[0]; 
-      * Take a filename with wildcards and return all files that match the 
-      * @param string $file a full path from the -f command-line parameter, with 
-      *  potential * and ? wildcards. 
-      * @return mixed if $file contains wildcards, returns an array of matching 
-      *                files, otherwise returns false 
-  * Sorting functions for the file list 
-  * Recursively add all the subdirectories of $contents to $dir without erasing anything in 
-  * @return array processed $dir 
-     while(- list ($one,$two)- =  each($contents))
 
-             $dir[$one] - =  set_dir($dir[$one],$contents[$one]);
 
-         } else $dir[$one] - =  $two;
 
-  * Recursively move contents of $struc into associative array 
-  * The contents of $struc have many indexes like 'dir/subdir/subdir2'. 
-  * This function converts them to 
-  * array('dir' => array('subdir' => array('subdir2'))) 
-  * @param array struc is array('dir' => array of files in dir,'dir/subdir' => array of files in dir/subdir,...) 
-  * @param array array form of 'dir/subdir/subdir2' array('dir','subdir','subdir2') 
-  * @return array same as struc but with array('dir' => array(file1,file2,'subdir' => array(file1,...))) 
-         foreach($contents as $dir - =>  $files)
 
-                     if (- isset ($contents[$c]))
 
-     if (!- isset ($struc[$me])) $struc[$me]- =  array();
 
-     $struc[$me] - =  setup_dirs($struc[$me],$dir,$contents);
 
 
	
		Documentation generated on Mon, 05 Dec 2011 21:50:54 -0600 by phpDocumentor 1.4.4